Splinter Cell: A Double Agent visszahozza Sam Fisher veterán ügynököt egy ellenségért, ellentétben azzal, amivel korábban szembesült. A pusztító támadás megállításához be kell hatolnia egy gonosz terrorista csoportba, és belülről el kell pusztítania. Először tapasztalja meg azt a könyörtelen feszültséget és élet dilemmákat, amelyek kettős szerként hatnak a bélre. Amikor behatol egy terrorista szervezetbe annak amerikai központjába, gondosan mérlegelnie kell tetteinek következményeit. Ölj meg túl sok bűnözőt, és felrobbansz. Túl sokat kapsz, és milliók halnak meg. Bármit megtesz, hogy teljesítse küldetését, de éljen ki. Új hiteles kütyük, amelyeket az ANS kormányzati szervei a terrorfegyverek mellett használnak a feketepiacon