Arion Sherwind és híres futballcsapattársai visszatértek egy új kalandba, de a Raimon Junior High-ban nem minden úgy van, ahogy lennie kellene.

Arion a futballtól mentes világban találja magát, és meg kell fejtenie titokzatos eltűnését, és vissza kell szereznie a helyét a világban.

Utazz vissza az időben, és hozz létre egy tizenegyet, hogy visszahozza a futballt a Nintendo 3DS és 2DS rendszerekre kiadott Inazuma Eleven Go Chrono Stones: Thunderflash játékban.



Jellemzők:

- A történet azzal kezdődik, hogy Arion Sherwind megdöbbenve fedezi fel, hogy a Raimon Junior High legendás futballhősei hirtelen ismeretlenek.
- Ahol egykor hatalmas futballstadionok álltak, ma baseballpályák állnak.
- Az Inazuma Eleven Go 2 közvetlenül a Holy Road játékok után játszódik.
- Matsukaze Tenma hős visszatért az okinavai gyerekek foci tanításáról.
- Amikor azonban visszatér a Raimon High School-ba, a futballklub eltűnt. Nincs feloszlatva, a diákok azt mondták neki, hogy a klub eleve nem is létezett.
- Ebben az alternatív időkeretben a barátait és magát Matsukaze-t más klubokba toborozták.
- A klub újjáélesztése érdekében Matsukaze-nek szembe kell néznie a titokzatos Alfa fiúval, aki azt állította, hogy teljesen bitorolja a futballt Matsukaze életéből.
- Toborozzon különböző karaktereket, nézzen szembe különböző ellenfelekkel, és idézzen meg különböző avatar vadállatokat Neppuban és Raimeiben.
- Még a zenei témák is különböznek ebben a két játékban.